המסגד ייני אחד משש המסגדים שהיו בעיר אדסה. המסגד ייני נבנה בשנת 1904 על ידי חסן פהמי פאשה היה אז המסגד השישי בעיר. והוא נחשב לאחד המסגדים היפים ביותר. זה מושפע מאדריכלות ביזנטית המיוחד שהוא המודל של הכנסייה איה סופיה קונסנדינופולי. המסגדים פעלו עד 1923 כשנה שהאוכלוסייה המוסלמית של העיר אדסה, כ 6000 אנשים עברו בהכרח לטורקיה, משום היה הסכם לוזאן, שהוטל על חילופי אזרחים. באביב 1923 המסגד ייני של אדסה נסגר על ידי הרשויות היוונית. המסגד הוסב למחסן של שירות הארכיאולוגי מהחסנים בו ממצאים ארכאולוגים של האזור מצבות מרשימות מבית הקברות המוסלמיים וודנה. למרות שרידי המסגד לא מנוצל והוא מוזנח והוא נמצא שלם ולא נותנים לאורחים לכנס ולבקר בו, לאורך זמן בולט קטעים מרשמים מהקראן העיצוב בתוך הכיפה, סיכון של לחות בחלק העליון של הצריח זה קרה ברעש ברעידת האדמה של שנת 1978.
בשנת 1937 הוכרזה כאנדרטה ובשנת 1942 (במהלך הכיבוש הגרמני) נחנך מוזיאון העיר.
המבנה מושפע מהארכיטקטורה הביזנטית ובאופן ספציפי הדגם של האגיה סופיה באיסטנבול. כיום מסגד ייני מציג תערוכות ארכיאולוגיות, ביזנטיות ותעשייתיות מאדסה והסביבה הרחבה. האוסף לרוע המזל אינו פתוח לקהל.